近江国甲賀郡（滋賀県甲賀市）を本国とし、のちに江戸幕府の西翼防衛（青山・千駄ヶ谷甲賀町）を担った甲賀武士の「起源」について、正史の背後に伏在する精神史的・軍事地政学的アプローチから解明するものである。特に、前述の遠藤宗家の始祖伝承（大伴細人／大伴細入）に代表される「聖徳太子（厩戸皇子）の軍事密旨」が、中世から近世にいたる甲賀武士の集団アイデンティティ（惣国一揆・甲賀二十一家）の形成において、いかなる象徴的かつ実利的な「正統性」として機能したかを学術的に総括する。

1. 聖徳太子の「軍事密旨」と大伴細人の情報戦メカニズム
歴史書『日本書紀』において、聖徳太子は崇仏・和の政治家として描かれるが、587年の「物部守屋の討伐（丁未の乱）」に象徴される通り、当時の権力闘争のただ中に身を置く軍事戦略家でもあった。この戦いにおいて、太子が発したとされる「軍事密旨」と、それを受託した大伴細人の動向は、日本における諜報・遊撃戦（忍術）の制度的原点として位置づけられる。

【聖徳太子軍事密旨から甲賀武士誕生への空間的変遷】

［中央：飛鳥朝廷］ ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
◆ 聖徳太子（厩戸皇子）による「軍事密旨」の発給
│ └── 既存の氏族秩序（物部氏等）を解体する特殊職能の要請
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［恩賞と称号］ 【志能便（しのび）】の称号拝領 ＝ 大伴細人（始祖）
│ └── 中央の正統性を帯びた「国家的スパイ・特殊工作部隊」の公認
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［空間的展開］ 近江国甲賀郡（山谷の割拠地）へ下向・定着
│ └── 天皇・東国・西国を結ぶ中継点（鈴鹿峠の防衛）
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［中世への昇華］ 【甲賀惣国一揆／甲賀二十一家（遠藤宗家など）】
└── 「我らは天皇（太子）直属の守護者」という集合的記憶
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• 物部守屋討伐における特殊工作
強大な軍事力を持つ守屋に対し、太子は正面衝突だけでなく、情報の遮断・攪乱、後方攪乱を画策した。この「密旨」を奉じた大伴細人は、優れた身体能力と地理的鑑別能力を用いて守屋軍の陣形や動向を克明に把握・報告し、勝利の決定打を演出した。
• 「志能便（しのび）」という国家公認の称号
この軍功により、太子から細人へ与えられた「志能便」の文字は、ただの技術（忍術）の呼称ではない。「志（こころざし）を能（よ）く便（べん）ずる（＝主君の意志を過不足なく、迅速に完遂する者）」という意味を内包した、朝廷最高中枢から直々に授けられた「国家官職的格式」であった。

2. 近江国甲賀郡の選地と「聖徳太子信仰」の地政学的理由
大伴細人を源流とする特殊職能集団が、なぜ近江国甲賀郡という山谷（谷戸地形）に深く根を張り、「甲賀武士（甲賀忍者）」として純化していったのか。そこには東国と西国を繋ぐ交通の要衝という地政学的必然性と、太子への「精神的臣従」の二重構造が存在する。

① 近江国東南部の「要塞的トポス」
甲賀郡は、鈴鹿山脈を背後に控え、伊勢・伊賀・大和・山城・美濃を結ぶ、古代からの中継地である。中央（朝廷）で変事があった際、いち早く情報を察知し、かつ山岳に拠ってゲリラ戦を展開できるこの地は、「志能便」の職能を平時において温存・再生産し、有事において朝廷（のちの幕府）に提供するための最適な「防衛セクター」であった。
② 「惣国一揆」を統合する最高位の権威（太子信仰）
中世、甲賀武士たちは特定の巨大大名に臣従せず、独立した国人領主たちが合議制で地域を統治する「甲賀惣国一揆」（郡中惣）を形成した。主君を持たない彼らが、集団の連帯と正統性を担保するための精神的支柱としたのが「聖徳太子信仰」であった。
「我ら甲賀衆のルーツは、地元の弱小武士などではない。かつて聖徳太子公の密旨を受け、天下の危機を救った大伴細人の血脈である」という創始伝承は、近江源氏（佐々木氏・六角氏）などの周辺大名からの不当な介入を拒絶するための、絶対的な神聖不可侵の防壁として機能した。

3. 德川幕府（德川家康公）による「太子の密旨」の再生産
この「太子の密旨を受けた特殊直属部隊」という甲賀武士の起源は、千年の時を超えて、慶長年間の德川家康公による「甲賀百人組」の結成、および江戸城大手三門（百人番所）の守護神への抜擢において、完璧な形でリバイバルされることとなる。
•「伏見城の殉忠」から「江戸城西翼の守護」へ
遠藤宗家の始祖・遠藤左太夫らが伏見城籠城戦で見せた、西軍（秀頼・三成）の巨万の富と領地安堵の誘惑を撥ね退けて書状を焼き捨て、本丸で全滅した「忠義」は、まさに「太子の志を能く便じた」大伴細人の精神の再現に他ならなかった。
•德川家康公による構造的見立て
家康公は、甲賀武士が抱く「中央の最高権威（太子）へのダイレクトな絶対忠誠」という精神構造を高く評価した。ゆえに、外様大名や譜代臣格のネットワークとは一線を画す「将軍直属の、国家最高機密を担う防衛コア（青山・千駄ヶ谷甲賀町および焔硝蔵の管理）」として、彼らを江戸城西翼外郭の最重要ラインに再配置したのである。

甲賀武士の起源に厳然と横たわる「聖徳太子の軍事密旨」と「大伴細人の志能便伝承」は、単なる後世の忍者たちによる「家系の箔付け（偽史）」として片付けられるべきものではない。それは、中世甲賀の独立割拠（惣国一揆）を支えた独自の政治思想であり、近世幕藩体制においては「德川将軍家への絶対的殉忠」を自己規定するための、強力な歴史的駆動装置（都市の遺伝子）であった。
遠藤姓の創始（桓武平氏・宇多源氏の結合）から、伏見での殉忠、そして江戸城外郭（千駄ヶ谷）の要塞化へと至る遠藤宗家の歩みは、この「太子の密旨」という聖なる起源が、時代ごとに衣服を着替えながら日本の防衛空間の要に立ち続けた歴史そのものなのである。